انیمیشن «شبح تسوشیما» درباره مدافعان افسانه ای ژاپن است که برای حفظ «جزیره تسوشیما» در برابر حمله مغول ها ایستادگی کردند. اما مغول ها خرابی های زیادی به بار آورده و توانستند فتوحات زیادی را در کشور ژاپن به دست بیاورند. در این میان آخرین سامورایی بازمانده از قبیله ساکای به نام «جین ساکای» پس از مشاهده این همه ویرانی به پا خواسته تا شهرهای تحت تصرف مغول ها را باز پس گیرد.